酶生物反應器在進行酶的催化反應中，由于酶的作用底物或反應后的產物種類較少，一般無法滿足微生物生長、繁殖的基本條件。但是，這并不意味著在酶生物反應器的操作過程中不用防范微生物的污染。

  
不同酶的催化反應由于底物、產物和催化條件的不同，在反應過程中受到微生物污染的程度往往具有較大的差別。對于底物或產物對微生物有抑制作用的催化反應、耐高溫或低溫、高pH或低pH、耐高鹽濃度或耐高壓的酶進行的催化反應、可以在非水介質中進行的催化反應來說，反應過程中受到微生物污染的可能性較小。但對于底物或產物是微生物所需的營養物質時，反應過程中便很容易受到微生物的污染。

  
微生物的污染會造成柱床或膜的堵塞，其生長繁殖還會消耗底物或產物，產生酶和代謝產物，進而使產物降解，或產生無用甚至有害的副產物，增加產物分離純化的負擔；此外還會使固定化酶活性載體降解。所以在酶生物反應器的操作過程中，需要采用微生物污染的防范措施，如：
 
1、保證生產環境的清潔，操作需符合必要的衛生條件。
2、設備使用前后需要進行清洗與消毒處理。使用前可用酸性水或含有過氧化氫、季銨鹽的水反沖；連續運轉過程中可用過氧化氫或50 ％的甘油水溶液周期性地清潔設備。此外，在操作前應提前考慮是否會對固定化酶的穩定性產生影響。
3、操作過程中應保持嚴格管理，并定期檢測，以避免微生物的污染。
4、在部分情況下，可向反應液中適當添加對反應與產品無副作用的抑菌殺菌物質，如抑菌劑、殺菌劑等，或對底物料液進行過濾，以降低微生物污染。
5、在不影響反應與產物的前提下，可選擇較高溫度(45 ℃以上)或在酸性或堿性緩沖液中進行操作，或使用高濃度底物來提高滲透壓和降低水分活度，以降低微生物污染。 
 
 
 

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